Суд признал 44-летнего мужчину виновным в том, что будучи главным редактором издания, учредителем которого является воронежская областная администрация, с 2006 по 2009 годы похитил около 20 млн рублей со счетов издания, заключая фиктивные договоры на рекламное обслуживание.
Пирогов был уволен с поста главного редактора «Молодого Коммунара» в конце августа 2009 года. Тогда он стал фигурантом уголовного дела о получении взятки в 100 тысяч рублей за публикацию в газете компромата на одного из воронежских предпринимателей. В апреле 2012 года региональное управление СК передало дело в суд. В ходе следствия была установлена причастность директора издания к другим правонарушениям.
В результате Пирогова обвинили в расточении государственного имущества и осудили по 4-й части 160-й статьи и 1-й части 285-й статьи УК РФ. Приговор суда — 4 года лишения свободы и отбывание наказания в колонии с общим режимом.